Feeds:
Pos
Komentar

Malam Bahagia + Membingungkan

Qaddarullah, mungkin hanya kata itu yang bisa saya ucapkan mengenai jalan hidupku ini. Di akhir-akhir waktu untuk persiapanku melanjutkan studi S3 di Australia, Pada suatu malam, tepatnya Malam 27 Ramadhan 1433 H, atau 16 Agustus 2012. Malam dimana saya mendapatkan informasi kelulusan beasiswa di Universitas King Abdul Aziz Jeddah, Saudi Arabia. Spontan sy bersyukur atas nikmat tersebut. Namun setelah beberapa saat, saya menjadi bingung. Kebingungan saya adalah karena saya juga telah mendapatkan beasiswa LN DIKTI untuk studi S3 di Monash University, Australia dalam topik yang sangat saya inginkan. Awal respon tentunya tidak tahu harus berbuat apa, Namun setelah diskusi dengan istri dan keluarga tentunya, Sy berusaha untuk shalat istiharah (mumpung masih dalam bulan ramadhan). Alhamdulillah, akhirnya yang bulat dihatiku adalah memilih beasiswa King Abdul Aziz University (Selanjutnya di singkat KAU aja ya).

Tapi masalah lain kembali muncul. Saya harus tiba di Saudi Arabia sebelum tanggal 8 September 2012. Waktu yang sangat singkat harus segera mengurus Visa dan mengurus Ijin studi lanjut di DIKTI lagi. Pokoknya pusing setengah mati saat itu. Namun berbekal keyakinan, bahwa bila ini jalanku, Insya Allah akan dimudahkan. Untuk urusan Visa, maka mau tidak mau, saya harus meminta bantuan dari Agen Pengurus Visa. Kebetulan setelah browsing sana sini, akhirnya bisa mendapatkan nomor kontak Agen Visa tersebut. Masalah bisa dianggap sudah beres. Untuk masalah ijin DIKTI, maka saya pun melakukannya sendiri dan mau tidak mau harus kejakarta. Ruwet juga masalah ijin DIKTI atau biasa disebut ijin Setneg ini. Dan karena ini belum selesai sampai batas waktu utk berangkat ke Saudi Arabia, terpaksa deh, ditinggal sementara dulu. Untuk saat ini, masih diproses katanya. Kata pegawai BPKLN kepada saya lewat telepon.  Semoga semuanya bisa beres karena mengingat proses belajar kan memerlukan ketenangan. Bila semua sudah beres, maka smoga proses menuntut ilmu di KAU ini juga bisa lancer….car….car. Amin.

Sekian dulu. Untuk pengalaman pertama kali datang dan kuliah di KAU mungkin ditulisan yang lain. Bila ada yang mau bertanya (sapatau aja ada yg dapet pengalaman kayak saya),jangan sungkan-sungkan. Dipersilahkan dengan hormat

Kali ini sy ingin berbagi tentang pengalaman hidup terutama yg menyangkut ramadhan. Semua kita tau apa dan bagaimana ramadhan itu. Ya…dia adalah satu bulan penuh dimana umat islam diwajibkan berpuasa bagi yang telah memenuhi syarat.

Bagi saya, ramadhan selalu spesial, bukan karena pada bulan itu ada banyak kue dan makanan buka puasa  yang enak-enak. Bukan….sekali lagi bukan. Sy merasakan bahwa ramadhan itu seperti pusat dimana hidup saya berputar. Segala sesuatu sepertinya berasal dan dimulai dibulan ramadhan. Hal itu membuat saya senantiasa merasa senang bila kedatangan bulan ramadhan. Sejak kecil, saya memang telah dididik untuk berpuasa pada bulan ramadhan, meskipun waktu itu hanya setengah hari. Beranjak dewasa,ramadhan saya anggap sebagai rutinitas saja. Puasa, makan, puasa, makan dan selesai. Namun, perubahan dan niat ingin mengubah diri itu saya ingat betul terjadi pada saat bulan ramadhan ketika saya sudah menjadi mahasiswa. Inilah mungkin momen pertama saya yang menjadikan ramadhan telah menjadi begitu special bagi saya. Ya….Ramadhan adalah suatu momentum. Tahu kan teori momentum?????  Ya…..Segalanya akan bisa menjadi lebih baik dan lebih berhasil ketika segala sesuatu dimulai dibulan ramadhan.

Ketika semua orang menuliskan harapannya dan keinginannya pada malam-malam tahun baru, malam-malam hari ulang tahun mereka, atau hari-hari lain yang mereka anggap special, mengapa mereka tidak menggunakan malam-malam ramadhan sebagai malam-malam penuh harap mereka??????

Ya… Didalam bulan ramadhan itu, ada sepuluh malam termulia yang kita dituntut untuk lebih banyak beribadah dan berdoa. Dialah sepuluh malam terakhir dari bulan ramadhan. Gunakanlah waktu ini untuk banyak-banyak beribadah dan berdoa. Panjatkan segala doa, harapan dan keinginan besarmu entah apakah itu untuk 1 bulan kedepan, 1 tahun kedepan ataupun beberapa tahun kedepan. InsyaAllah, engkau akan merasakan yang namanya Momentum Ramadhan yang akan menandai perjalanan hidupmu selanjutnya dalam usaha mencapai ridha Allah tentunya.

Selamat mencoba!!!!!!!!!!!!!!

Farmakologi Bahan Alam

Yup….Tema diatas sy angkat berkaitan dengan tugas mengajar saya dalam mata kuliah farmakologi bahan alam. Pikir dipikir, emang apa ya yang mau diajarkan. Bingung juga. Tapi berbekal buku Kimia dan Farmakologi Bahan Alam punya Prof. Sumali, Sy pun mencoba mengajarkan. Ternyata enak juga ya, setidaknya saya bisa belajar farmakologi lagi. Selama ini saya sibuk ngajar fitokimia, mulai dari ekstraksi sampai isolasi senyawa bahan alam. Ternyata dengan mengajar farmakologi bahan alam, mantap banget gabungin aktivitas bahan alam tertentu yang telah diketahui aktif digunakan sebagai obat dengan penjelasan aktivitas farmakologi secara molekuler. kalo bagian yang terakhir ini, sy juga lagi senang2nya nih belajr karena akan fokus di kimia medisinal yang ujung2nya ya temuin obat yang mempunyai aktivitas farmakologi secara molekuler juga. wuh……ilmu itu ternyata saling berkaitan.So….jangan pernah berhenti belajar. Bagi yang pengen download slide mata kuliahku, bisa download di bagian download. Oke

Membuat Animasi Docking

Interaksi Lunacridine-DNA

Bismillah.

Docking adalah suatu metode komputasi untuk melihat interaksi suatu molekul kecil obat terikat pada Reseptornya. Pada penelitian yang ane lakukan, alhamdulillah berhasil memvisualisasikan model interkalasi lunacridine terhadap DNA. Lunacridine yang diisolasi dari kayu Sanrego (Lunasia amara Blanco) memang telah diketahui sebagai penghambat DNA Topo II dengan mekanisme interkalasi. Hal ini disebabkan karena struktur planar dari cincin kuinolinnya. Untuk memvisualisasikan model tersebut, maka dibuatlah animasinya. menyenangkan bukan, bisa memperlihatkan secara komputasi interaksi suatu obat,hehehehe. Caranya mudah saja.

1. Hasil2 docking disave gambarnya dalam bentuk gif. bila run dockingnya ada 10x berarti model gambarnya yang disave juga ada 1o model

2. dengan fasilitas software UnFrezz, maka dibuatlah animasi tersebut.

jadi deh!!! silahkan mencoba sendiri.

Untuk Animasi docking saya dapat diklik disini.

Replikasi  DNA dimulai pada suatu sequen dari nukleotida yang disebut “origin of replication”

Helicase menguraikan  DNA helix untai ganda, kemudian protein yang terikat pada untai tunggal (single strand binding protein) berikatan dengan bagian untai tunggal DNA dan menstabilkannya

DNA polymerase III adalah enzim utama yang  terlibat dalam DNA replikasi. DNA polymerase III hanya dapat menambahkan suatu nukleotida pada ujung 3’ dari rangkai rantai nukleotida yang ada dan DNA polymerase III tidak dapat menginisiasi suatu rantai nukleotida .

OKI, suatu RNA polymerase yang disebut primase, membentuk suatu RNA primer, suatu sekuen yang terdiri dari 10 nukleotida, yang melengkapi  DNA parent

DNA Polimerase III kemudian dapat menambahkan deoksiribonukleotida untuk mensintesis untai komplementer baru DNA

Karena dua untai parent DNA  adalah antipararel (tidak sejajar), maka mereka diorientasikan dalam arah yang berlawanan dan oleh karena itu harus diperpanjang dengan mekanisme yang berbeda

Perpanjangan Leading strand kearah cabang replikasi dengan penambahan nukleotida yang senantiasa terus bersambung dengan pertambahan pada ujung 3’

Sebaliknya,  lagging strand, yang memperpanjang diri menjauh dari cabang replikasi, disintesis secara tidak bersambung sebagai suatu seri yang pendek, yang disebut fragment okazaki.

Ketika  DNA polymerase III mencapai  RNA primer pada lagging strand, ia digantikan kembali oleh DNA polymerase I, yang memindahkan RNA dan menggantinya dengan DNA. DNA ligase kemudian masuk dan membentuk ikatan fosfodiester

DNA kemudian tidak diikat lagi. Primer baru sudah terbentuk, dan DNA polymerase III bekerja lagi dengan membentuk fragment okasaki lainnya

animasinya dapat didownload disini

Sumber : McGraw Hill Companies. Inc

autodock 2Autodock merupakan aplikasi yang populer digunakan saat ini dalam studi docking molekuler. Software ini dapat anda download secara gratis di sini. Untuk melakukan setingan docking antara Ligand dengan Reseptor maka dibutuhkan software Autodock Tools (ADT), yang dapat juga didownload secara gratis di sini. Untuk informasi lebih lanjut dapat anda buka situs http://www.molmod.org

Aplikasi ini sebenarnya berbasis linux dan hasil docking juga bagus bila run di sistem operasi Linux, namun bagi yang ngga mau ribet dengan sistem Linux dan ingin menggunakannya di windows, aplikasi ini juga dapat jalan. Caranya dengan menginstalasi Cygwin yang dapat didownload di sini. Cygwin merupakan terminal Linux di windows. Perintah untuk running Autodock dapat dijalankan di Cygwin.

Selamat mencoba!

Note : The Scripps Research Institute telah merelease autodock vina yang bisa digunakan dgn command prompt di windows, tanpa perlu cygwin lagi.

3D_earth_02 Bismillahirrahmanirrahim

Kajian Tafsir QS.As Sajdah yang dibawakan oleh Al Ustadz Khaidir Setiap Malam Rabu di Mesjid Galangan Kapal Makassar, InsyaAllah dapat didownload disini secara bertahap.

Untuk Tafsir As Sajdah  dapat didownload pada halaman download diatas atau klik disini

Semoga materi ini bermamfaat.

Jazakallahkhaeran katsiran

Assalamualaikum wr.wb

Berikut pengalaman saya dalam memasang banner Blog di facebook :

abuumar80 Blog Banner

abuumar80 Blog Banner

Setelah caritau banyak lewat situs-situs Blog, akhirnya ku coba membuat Logo Blog saya secara online di www.cooltext.com. Dengan memilih Logos — lalu memilih bentuk logo yang diinginkan serta ukurannya, akhirnya di render Logo. setelah itu hasil Logonya dapat kita download dan kita dapat juga memperoleh kode HTML-nya dengan klik Get HTML, yang hasilnya seperti berikut :

Lanjut Baca »

Sabtu, 18 November 2006
Penulis: Al Ustadz Abu Muhammad Dzulqornain

Pertanyaan No. 1 :
Dewasa ini marak pengakuan dari berbagai pihak yang mengklaim dirinya Ahlus Sunnah Wal Jama’ah sehingga menyebabkan adanya kerancuan dan kebingungan dalam persepsi banyak orang tentang Ahlus Sunnah Wal Jama’ah, siapakah sebenarnya Ahlus Sunnah Wal Jama’ah itu ?


Jawab :
Mengetahui siapa Ahlus Sunnah Wal Jama’ah adalah perkara yang sangat penting dan salah satu bekal yang harus ada pada setiap muslim yang menghendaki kebenaran sehingga dalam perjalanannya di muka bumi ia berada di atas pijakan yang benar dan jalan yang lurus dalam menyembah Allah sesuai dengan tuntunan syariat yang hakiki yang dibawa oleh Rasulullah empat belas abad yang lalu.

Lanjut Baca »

hyperchemHyperchem, merupakan tools dasar dalam molecular modeling. Software ini dapat digunakan untuk menggambar struktur kimia, optimasi geometri dengan berbagai macam metode, study molecular dinamik dasar, study QSAR, dll

Untuk panduan Hyperchem, dapat dibaca dimenu Help pada software ini. Aplikasi QSAR dengan Hyperchem akan dibahas lebih lanjut pada pembahsan yang lain.

Untuk download software Hyperchem 7.5, silakan klik disini

Terimakasih